广东医科大学的前身是中山医学院湛江分院，创建于1958年，1964年更名为湛江医学院，1986年获批硕士学位授权单位并列为广东省属重点建设大学，1991年获广东省办学水平评估一等奖，1992年更名为广东医学院，2005年在教育部本科教学工作水平评估中获“优秀”，2013年获批为博士学位授予单位，2015年5月学校临床医学进入ESI全球排名前1%，2016年更名为广东医科大学。2017年通过教育部本科教学工作审核评估，2019年进入高等教育研究机构世界大学排名中心（CWUR）和USNews世界大学排行榜榜单，2021年进入广东省高水平大学建设计划重点学科建设高校行列，2023年获批临床医学博士后科研流动站。

临床医学专业始建于1958年建校之初，是学校创办最早的专业，1964 年招收首届本科生，1986年开始培养硕士研究生，2014年招收首届博士研究生。临床医学专业2004年获批广东省名牌专业，2007年获批国家级特色专业，2011年获批广东省重点专业，2012年获批广东省专业综合改革试点项目，2014年获批广东省卓越医师培养计划专业和应用型人才培养模式创新实验区，2019 年通过教育部临床医学教学指导委员会专业认证，有效期6年，2020年临床医学专业立项为国家级一流本科专业建设点。

临床医学学科1986年获批硕士学位授予权、2013年获批博士学位授予权，2015年临床医学学科进入ESI全球排名1%（2024年5月2.37‰），是广东省高水平大学重点建设学科、广东省攀峰重点学科。学校临床医学专业已经形成了本、硕、博完整的人才培养体系，并拥有临床医学博士后科研流动站。临床医学专业的教学任务分别由湛江校区的第一临床医学院和东莞校区的第二临床医学院承担。